Образуется из крупных фолликулов, переполненных коллоидом. Возникает в аденоматозно измененной ткани щитовидной железы в любом возрасте, но чаще всего наблюдается у детей. Диаметр кисты колеблется от 30 до 80 мм. Полость кисты заполнена мукоидной жидкостью.

При пункции кисты получают несколько миллилитров прозрачной, желтоватой или бурой, мутной жидкости. В буром и мутном пунктате отмечается, как правило, обильный осадок. В такой жидкости при микроскопическом исследовании нативного препарата обнаруживают большое количество измененных эритроцитов и их обломков, гемосидерин, а иногда и кристаллы холестерина. При большом количестве кристаллов холестерина поверхность жидкости опалесцирует. Гемосидерин располагается внутри клеток, а также вне их, образуя обширные внеклеточные скопления, покрывающие весь препарат и создающие впечатление загрязненности.

Из клеток кроме эритроцитов нередко выявляется большое количество фагоцитов, гигантские клетки инородных тел и уплощенные фолликулярные клетки щитовидной железы без каких-либо включений. При воспалении кисты в пунктате находятся клетки, характерные для воспаления, а при наличии пролиферации эпителия можно обнаружить пролиферирующие эпителиоциты.